呼伦贝尔市科学技术协会（简称呼伦贝尔市科协），原呼盟科协是1957年中共中央、国务院下发关于《各地、市普遍建立科学技术协会》的通知后开始组建，1958年6月正式成立，是中国科协的地方组织。
1983年机构改革呼盟科协同呼盟科委合署办公，称盟科技处。
1987年3月，呼盟科协召开第一次代表大会，会议提出：各级科协及所属团体要发挥科协组织作为党和政府联系科技工作者的桥梁纽带作用。结合呼盟实际，努力发挥科技团体的优势和职能，贯彻落实“林牧为主、多种经营”的方针，使科学技术成为“念草木经、兴畜牧业”的突出力量。
2002年，呼伦贝尔撤盟设市后，呼伦贝尔市科协于2002年10月召开全市科协第一次代表大会。
2008年11月呼伦贝尔市科协召开第二次代表大会，大会选举产生呼伦贝尔市科协第二届委员会委员、主席、副主席、常委、秘书长。
目前，呼伦贝尔市科协已形成覆盖理、工、农、医、畜牧、环保等多学科、涉及城乡社区、企业和学校等多领域、多层次的组织网络。全市13个旗市区科协全部独立建制。现有学会31个，会员6125人。拥有全国科普示范城（区） 个，国家级科普教育基地2个，自治区青少年科技教育示范基地2个，自治区青少年科技教育示范学校4个。
